Las lagunas y los lagos de Perú pueden ser de origen glaciar (producto de los deshielos de la nieve de las montañas) o de origen tectónico (fruto del hundimiento de la corteza terrestre).
De color celeste, azul, verde o turquesa, resultan atractivos naturales que brindan vida a su paso por los diversos pueblos, generando energía, garantizando el crecimiento de los cultivos, siendo fuente de vida de diversos peces y satisfaciendo la demanda de consumo humano.
El Perú cuenta con más de 12 mil lagos y lagunas, de los cuales la mayoría se encuentran en la vertiente oriental de la cordillera de los Andes. El lago más grande e importante del país es el Lago Titicaca, el lago navegable más alto del mundo. Siguiéndole en tamaño se encuentra el Lago Junín y la Laguna de Arapa.
La mayoría de los ríos peruanos se forman debido a los deshielos de los glaciares ubicados en la cordillera de los Andes. Otros ríos se forman de manera estacionaria producto de fenómenos climáticos extremos como el Fenómeno "El Niño". (ENSO).
Mención especial merece el río Amazonas, considerado el más caudaloso del mundo y, según últimos estudios, el más largo del planeta. Nace en las alturas de la provincia de Caylloma, en el departamento de Arequipa, y luego de un largo recorrido, en la confluencia de los ríos Marañón y Ucayali, toma el nombre de Amazonas. Sus aguas vierten al mar 170 mil metros cúbicos por segundo y alberga a más de 2 mil especies de peces.
Debido a la compleja historia geológica de los Andes, el Perú también cuenta las fuentes termales y géisers que tienen una amplia distribución en la costa, sierra y selva del país. Las fuentes termales más famosas son los “Baños del Inca” ubicados en Cajamarca donde se dio el encuentro entre Francisco Pizarro y el Inca Atahualpa. Por otro lado, se pueden encontrar géisers en zonas con alta hay actividad volcánica, los lugares más conocidos son Pinchollo en Arequipa y Calientes en Tacna.
Las cataratas o saltos de agua se forman cuando un curso de agua encuentra una superficie resistente a la erosión generando saltos o caídas. Algunas pueden observarse cerca de algún camino, pero otras esconden su belleza tras horas de caminata, entre la densa vegetación. Las cataratas más altas del Perú son las Tres Hermanas, en el departamento de Junín, con una altura total de 914 metros. Por otro lado, la catarata de Gocta, ubicada en el distrito de Valera, provincia de Bongorá, en el departamento de Amazonas, tiene una altura total de 771 metros y una caída libre de 540 metros. Es por ello que es considerada como la quinta caída libre de agua más alta del mundo.